stereo 注释结果分类
这些术语是空间转录组学和基因组学中常见的测序数据分类方式,它们描述了不同类型的读取(reads)在基因组中的映射情况。以下是这些术语的详细解释:
1. Exonic(外显子区域)
- 解释:指那些唯一地映射到外显子区域的测序读取(reads),并且与基因组上相同的链一致。外显子是基因中编码蛋白质的部分。
- 意义:外显子区域的读取直接代表正在被转录并有可能翻译为蛋白质的 mRNA。因此,这些读取是功能性转录物的一个重要标志。
2. Intronic(内含子区域)
- 解释:指那些唯一地映射到内含子区域的测序读取,且与基因组上的链一致。内含子是基因中不编码蛋白质的部分,它们在转录后通常会被剪接掉。
- 意义:内含子区域的读取可能来自不完全剪接的 RNA 或处于剪接中的前体 mRNA,因此这些读取提供了基因转录和 RNA 加工的额外信息。