Stereo-seq 中， CID 和 MID 之间的区别

在 Stereo-seq（空间转录组学）技术中，CID 和 MID 是两种用于追踪和识别测序数据不同维度信息的标识符。它们分别代表不同的功能和作用：

1. CID（Coordinate ID，坐标标识符）

• CID 是 Coordinate ID 的缩写，用于表示空间位置信息。在 Stereo-seq 中，CID 通过分子条形码标记每个分子的空间坐标信息，即细胞或组织样本中每个检测到的分子的物理位置。

• 作用：CID 主要用于标识每个分子的空间位置信息，这对于空间转录组学尤为重要，因为它能够将每个 RNA 分子精确映射到样本中的特定位置，从而帮助研究人员在组织中绘制分子表达的空间分布图。

• Q30：CID Q30 表示那些代表空间坐标信息的 CID 碱基中，测序质量值大于 30（表示错误率小于 0.1%）的比例。Q30 是测序数据质量的常用评估标准，Q30 以上的碱基具有较高的测序准确性。