CATH数据库数据下载

CATH数据库提供了多种类型的数据供用户下载，涵盖了蛋白质的结构域分类、同源性分析、功能注释等方面。以下是CATH数据库提供的一些主要数据类型及其解释：

http://www.cathdb.info/download

1. 分类数据（Classification Data）

• 文件：如cath-domain-list.txt
• 内容：包含CATH数据库中所有蛋白质结构域的分类信息，按照CATH四级分类系统组织（Class、Architecture、Topology、Homologous superfamily）。
• 解释：每一行表示一个结构域的分类信息，包括PDB ID、链ID、CATH分类号（CATH四级编号），这些编号可以帮助用户了解每个结构域在CATH分类中的位置。

2. 非冗余数据集（Non-redundant Data Sets）

• 文件：如cath-dataset-nonredundant-S40-v4_0_0.list